I livelli di GlycA per l’identificazione d’infiammazioni croniche e future gravi infezioni. The levels of GlycA for the identification of chronic inflammation and future serious infections.
I livelli della Glicoproteina Acetilazione (GlycA) per l’identificazione d’infiammazioni croniche e future gravi infezioni / The levels of acetylation glycoprotein (GlycA) for the identification of chronic inflammation and future serious infections.
Una recente pubblicazione nella rivista Cell
Systems prospetta la possibilità di prevedere
infiammazioni croniche, attività neutrofila ed il
rischio di future gravi infezioni grazie ad un nuovo
biomarcatore. Il team internazionale di ricercatori
ha individuato nella Glicoproteina Acetilazione
(GlycA), il prodotto del catabolismo in corso di un
processo infiammatorio, questo marcatore.
Precedenti studi avevano evidenziato come la
GlycA potesse essere un biomarcatore utile per
predire il rischio di patologie cardiovascolari e di
tutte le cause di morte.
Questo nuovo studio è stato sviluppato facendo un
accorto uso di dati di omica e cartelle cliniche di
oltre 10.000 individui; dall’analisi dei registri
relativi a ricoveri e decessi legati ad infezioni è
infatti risultato che elevate concentrazioni di
GlycA sono correlati, a lungo termine, al rischio di
sviluppare gravi infezioni; nei casi valutati dagli
studiosi gli alti livelli di GlycA erano connessi ad
un alto rischio di ricovero e/o decesso a causa di
diverse infezioni e loro complicazioni (ad es.
setticemie e polmoniti). Scott C. Ritchie, uno degli
autori, scrive “negli individui apparentemente sani,
concentrazioni elevate di GlycA corrispondevano
ad un incremento di una miriade di citochine
infiammatorie, così come ad una rete di
coespressione genica sintomatica di un’aumentata
attività neutrofila, suggerendo che gli individui con
elevata GlycA possano trovarsi in uno stato di
cronica infiammazione.” Oltre a dimostrare
l’efficacia del GlycA come biomarcatore per
l’infiammazione cronica, l’attività neutrofila ed il
rischio di future gravi infezioni, questo lavoro
dimostra l’utilità intrinseca nell’approccio
coordinato di dati di omica e follow-up a lungo
termine di cartelle cliniche per identificare processi
a livello cellulare associati a biomarcatori scoperti
recentemente.
Significato di -omica.
In biologia molecolare, ci si riferisce comunemente
al neologismo omica (in inglese omics) per
indicare l'ampio numero di discipline
biomolecolari che presentano il suffisso "-omica",
come avviene per la genomica o la proteomica. Il
suffisso correlato -oma (in inglese -omes) indica
invece l'oggetto di studio di queste discipline
(genoma, proteoma).
Origini del termine
Il successo del suffisso più generale "-om-" ha
avuto origine dall'ampio uso che il termine
"genoma" ha riscosso nella comunità scientifica.
La prima apparizione di questa terminazione, in
realtà, è da ricondurre al termine bioma. Anche se
alcuni fanno risalire l'origine di questo suffisso a
cromosoma, tale correlazione è quantomeno
inesatta. Cromosoma deriva dal greco "χρωμ(ατ)-"
(colore) e "σωμ(ατ)-" (corpo). Appare dunque
evidente che il suffisso di cromosoma (-soma,
appunto) è diverso da -oma.
La moda di creare nuovi "-oma" può essere fatta
risalire intorno al 1995, all'interno delle comunità
dei bioinformatici di Cambridge, Stanford, Yale,
Harvard ed altri importanti centri di ricerca. Nella
seconda metà degli anni '90, dunque, si iniziò a
diffondere nella comunità scientifica la
convinzione che il suffisso "-oma" potesse
facilmente etichettare qualsiasi disciplina in corso
di formazione. Nacquero così il metaboloma, il
textoma, l'interattoma, il bacterioma, l'eukaryoma,
il neuroma e
molti altri.
Nell'opinione di buona parte della comunità
scientifica permane l'idea che il suffisso -oma sia
di origine greca. Poiché genoma indica la totalità
del materiale genetico di un organismo, infatti, è
opinione diffusa che il suffisso -oma indichi la
totalità di quanto indicato nel prefisso. Ad ogni
buon conto, non esiste alcuna correlazione tra tale
suffisso e la lingua greca antica. Alcuni, poi,
ritengono che -oma possa derivare dal latino omni-
(che ben esprime l'idea di tutto): tale
interpretazione sembra forzata, se non del tutto
priva di fondamento.
In ogni caso, in seguito alla diffusione di progetti di
biologia quantitativa applicati su larga scala (come
il Progetto Genoma Umano), il suffisso "-oma" è
stato adottato dalle comunità dei bioinformatici e
dei biologi molecolari, che hanno continuato ad
usarlo per etichettare le numerose discipline di
recente istituzione.
ENGLISH
A recent publication in the journal Cell Systems
raises the possibility of providing chronic
inflammation, neutrophil activity and the risk of
future serious infections thanks to a new
biomarker. The international team of researchers
has identified Glycoprotein acetylation (GlycA),
the product of the breakdown in the course of an
inflammatory process, this marker. Previous
studies had shown that the GlycA could be a useful
biomarker for predicting the risk of cardiovascular
disease and all causes of death.
This new study was developed by a judicious use of
omics data and medical records of more than
10,000 individuals; analysis of the records relating
to hospitalizations and deaths related to infections
is in fact the result that high concentrations of
GlycA are related, long-term, the risk of
developing serious infections; in cases assessed by
scholars the high levels of GlycA were connected
to a high risk of hospitalization and / or death due
to various infections and their complications (eg.
septicemia and pneumonia). Scott C. Ritchie, one
of the authors, writes "in apparently healthy
individuals, high concentrations of GlycA
corresponded to an increase of a myriad of
inflammatory cytokines, as well as a network of
symptomatic gene co-expression of an increased
neutrophil activity, suggesting that individuals with
high GlycA may be in a state of chronic
inflammation. "in addition to demonstrating the
effectiveness of GlycA as a biomarker for chronic
inflammation, neutrophil activity and the risk of
future serious infections, this work demonstrates
the inherent usefulness in 'coordinated approach of
omics data and follow-up of long-term medical
records to identify processes at the cellular level
associated with newly discovered biomarkers.
Meaning of -omics.
In molecular biology, there commonly refers to the
neologism omica (in English omics) to indicate the
large number of biomolecular disciplines that
present the "-omics" suffix, as is the case for
genomics or proteomics. The suffix related -OMA
(in English -omes) indicates the object of study of
these disciplines (genome, proteome).
Origins of the term
The success of the more general suffix "-om-" had
originated from the large use of the term "genome"
has received in the scientific community. The first
appearance of this termination, in fact, is due at the
end biome. Although some trace the origin of this
suffix a chromosome, such a correlation is at least
inaccurate. Chromosome comes from the greek
"χρωμ (ατ) -" (color) and "σωμ (ατ) -" (body). It is
therefore apparent that the chromosome suffix
(-soma, in fact) is different
from -OMA.
The fashion of creating new "-OMA" can be traced
back to around 1995, within bioinformatics
community of Cambridge, Stanford Yale, Harvard
and other leading research centers. In the late '90s,
therefore, it began to spread in the scientific
community the belief that the "-OMA" suffix could
easily label any discipline in training. Thus were
born the metabolome, the textoma, the
interactome, the bacterioma, the eukaryoma, the
neuroma and many others.
In the opinion of most of the scientific community
is still the idea that the -OMA suffix is of Greek
origin. Since genome indicates the totality of the
genetic material of an organism, in fact, it is
widely believed that the -OMA suffix to indicate
the totality of what is indicated in the prefix. In any
event, there is no correlation between this suffix
and ancient Greek language. Some, then, believe
that -OMA may derive from the Latin omni (which
well expresses the idea of all): this interpretation
seems forced, though not entirely without
foundation.
However, following the spread of large-scale
applied quantitative biology projects (such as the
Human Genome Project), the "-OMA" suffix has
been adopted by the community of bioinformatics
and molecular biologists, who have continued to
use it to label the number of newly established
disciplines.
https://it.wikipedia.org/wiki/-omica
Commenti
Posta un commento